Molslinjen è specializzata nell'offrire collegamenti veloci dallo Jutland all'isola principale danese di Zealand e gestisce due rotte: Le partenze avvengono dai porti di Aarhus e Ebeltoft sulla costa baltica dello Jutland, con Aarhus come porto principale. Per quanto riguarda la Zelanda, si fa sempre scalo al porto di Odde, nell'estremo nord-ovest dell'isola. Su queste due rotte, Molslinjen gestisce tre traghetti espressi con una capacità di oltre 1000 passeggeri e ben 400 auto.
Viaggiando a una velocità di circa 60-70 km/h, questi traghetti veloci offrono tempi di percorrenza impareggiabili: 75 minuti (da Aarhus a Odden on Zealand) e 55 minuti (da Ebeltoft a Odden). Da Odden, la capitale Copenaghen dista poco più di 100 chilometri. Ciò rende i traghetti un'alternativa interessante al collegamento stradale di quasi 200 chilometri da Aarhus a Copenaghen attraverso l'isola di Funen e il ponte sul Grande Belt.
A bordo sono presenti strutture per la ristorazione con un ristorante, una caffetteria e un salone, nonché aree gioco per i bambini. Non ci sono ponti aperti perché si tratta di traghetti veloci. Non ci sono nemmeno cabine a bordo delle navi Molslinjen, perché non sarebbero necessarie dati i brevi tempi di percorrenza.
I collegamenti giornalieri da Aarhus sono sette-otto in inverno e fino a dodici in estate. La rotta Ebeltoft-Odden è operata solo una volta al giorno in estate.
Molslinjen opera anche tre rotte dal porto di Rönne, sull'isola danese di Bornholm nel Mar Baltico, con il nome di Bornholmslinjen: per Sassnitz, sull'isola tedesca di Rügen, per Köge, sull'isola danese di Zealand, e per Ystad, nella Svezia meridionale.