Il porto di Heraklion si trova sull'isola greca di Creta e offre collegamenti con le altre 18 isole greche di Syros, Folegandros, Paros, Anafi, Creta, Ios, Amorgos, Naxos, Tinos, Chalki, Koufonissi, Milos, Thira, Karpathos, Mykonos, Kasos, Rodi e Sifnos, oltre che con il porto del Pireo sulla terraferma greca. Un totale di 21 rotte sono offerte più volte alla settimana dalle compagnie di navigazione Blue Star Ferries, SeaJets, Cyclades Fast Ferries e Minoan Lines.
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