Igoumenitsa, con le sue imponenti montagne sullo sfondo, non è solo un luogo panoramico, ma anche il porto più grande e importante della Grecia occidentale. È uno snodo centrale per i collegamenti internazionali e nazionali dei traghetti e gestisce circa 1,5 milioni di passeggeri all'anno.
Il porto è diviso in due aree principali: la banchina centrale e la banchina settentrionale. La banchina centrale, sulla costa meridionale della città, è specializzata nei collegamenti internazionali. Da qui partono i traghetti per porti italiani come Ancona, Venezia, Bari e Brindisi. Questo molo è facilmente raggiungibile sia a piedi che in auto, in quanto è collegato all'autostrada Egnatia Odos ed è vicino ai cancelli d'ingresso e al terminal passeggeri.
Il molo settentrionale è destinato alle linee di traghetti nazionali e si trova vicino al centro di Igoumenitsa. Da qui partono i principali traghetti per le isole Ionie, Corfù e Paxos. Con negozi, banche e ristoranti nelle vicinanze, è un luogo vivace, facilmente raggiungibile attraverso il viale Apostolon.
Igoumenitsa è un importante porto di traghetti per l'Italia con partenze regolari durante tutto l'anno. A seconda della destinazione, la traversata dura tra le 7 e le 24 ore, e la maggior parte delle traversate avviene durante la notte.
Per i viaggiatori che desiderano scoprire le bellezze delle Isole Ionie, Igoumenitsa offre traversate regolari per Corfù e Paxos, con la traversata per Corfù che dura solo 1,5 ore. Durante i mesi estivi è possibile fare scalo anche al porto di Sami, a Cefalonia.