Le port de ferry d'Héraklion se trouve sur l'île grecque de Crète et offre des liaisons avec les 18 autres îles grecques de Syros, Folegandros, Paros, Anafi, Crète, Ios, Amorgos, Naxos, Tinos, Chalki, Koufonissi, Milos, Thira, Karpathos, Mykonos, Kasos, Rhodes et Sifnos ainsi qu'avec le port de ferry du Pirée en Grèce continentale. Au total, 21 itinéraires sont proposés plusieurs fois par semaine par les compagnies maritimes Blue Star Ferries, SeaJets, Cyclades Fast Ferries et Minoan Lines.
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