Il existe des liaisons directes en ferry vers l'Estonie au départ de la Suède et de la Finlande. Les deux compagnies maritimes Tallink et Viking Line proposent des liaisons directes entre Stockholm et Tallinn, avec une courte escale à Mariehamn sur les îles Åland. Des ferries circulent également plusieurs fois par jour entre Helsinki et Tallinn, la traversée ne dure que deux heures.
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