El puerto de Pythagorio se encuentra en la isla griega de Samos y ofrece conexiones con las otras 12 islas griegas: Fournoi, Lipsi, Leros, Ikaria, Agathonisi, Patmos, Astypalea, Samos, Kos, Kalymnos, Rodas y Arki, así como con Turquía. Las navieras SAOS Ferries, Dodekanisos Seaways, Meander Travel y Makri Travel ofrecen un total de 12 rutas varias veces por semana.
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