Der Fährhafen auf der Insel Koufonissi bietet Verbindungen zu den 15 anderen griechischen Inseln Folegandros, Paros, Serifos, Schinoussa, Amorgos, Ios, Kreta, Naxos, Iraklia, Koufonissi, Milos, Thira, Donoussa, Mykonos und Sifnos sowie zum Fährhafen Piräus auf dem griechischen Festland. Insgesamt 18 Routen werden mehrmals täglich von den Reedereien Blue Star Ferries, SeaJets und Small Cyclades Lines angeboten.
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